Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms