Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf58Q2M2W7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms