Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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