Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B3Q16720 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B3Q16720 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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