Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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