Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF2Q15853 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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