Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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