Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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