Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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