Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms