Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms