Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A1Q15459 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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