Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.129e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.159e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.169e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.239e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56.33□□□□□ -1.49e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 DLST-201ENST00000238671 1464 ntTSL 210.57□□□□□ -0.722e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 DLST-204ENST00000554612 1479 ntTSL 28.75□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 LTBP3-210ENST00000528516 3935 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 LTBP3-207ENST00000526927 2750 ntTSL 216.39■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 LTBP3-218ENST00000530866 3756 ntTSL 212.59□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 NLRP1-205ENST00000544378 5281 ntTSL 212.38□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 527.77■■■□□ 2.042e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.712e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 RNF126-203ENST00000589762 963 ntTSL 223.69■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 RNF126-204ENST00000590885 1436 ntTSL 516.71■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.159e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.069e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 VCP-203ENST00000448530 950 ntTSL 518.02■□□□□ 0.487e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 VCP-202ENST00000417448 722 ntTSL 316.16■□□□□ 0.187e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 NUP214-226ENST00000531600 1775 ntTSL 211.64□□□□□ -0.554e-14■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 NUP214-205ENST00000465486 1068 ntTSL 1 (best)7.97□□□□□ -1.134e-14■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 NUP214-218ENST00000528114 575 ntTSL 47.09□□□□□ -1.274e-14■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 NUP214-213ENST00000525384 840 ntTSL 1 (best)5.98□□□□□ -1.454e-14■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.227e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.287e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 RPL17-210ENST00000581091 573 ntTSL 210.49□□□□□ -0.733e-10■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 NAPA-218ENST00000598615 379 ntTSL 36.43□□□□□ -1.389e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 318.25■□□□□ 0.519e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 215.57■□□□□ 0.089e-8■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 CSTF2-204ENST00000475126 1693 ntTSL 510.51□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.914e-10■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 312.77□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 514.76□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-9■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.511e-9■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-9■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-9■■■■■ 31.1
SF3B4Q15427 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.781e-9■■■■■ 31.1
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SF3B4Q15427 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 31
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SF3B4Q15427 DHX30-213ENST00000476446 752 ntTSL 220.66■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 31
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SF3B4Q15427 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.127e-7■■■■■ 31
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SF3B4Q15427 POGZ-217ENST00000529669 949 ntTSL 55.1□□□□□ -1.597e-7■■■■■ 31
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SF3B4Q15427 MST1-218ENST00000494809 859 ntTSL 314.22□□□□□ -0.132e-17■■■■■ 31
SF3B4Q15427 MST1-212ENST00000489007 737 ntTSL 313.64□□□□□ -0.232e-17■■■■■ 31
SF3B4Q15427 DDIT4-202ENST00000471240 521 ntTSL 219.53■□□□□ 0.722e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)19.02■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 31
SF3B4Q15427 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 31
SF3B4Q15427 SMPD4P1-201ENST00000416717 2263 ntBASIC9.24□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.248e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-225ENST00000583834 1993 ntTSL 315.81■□□□□ 0.128e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -08e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.248e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.318e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.338e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.338e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.398e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-227ENST00000584022 1103 ntTSL 212.56□□□□□ -0.48e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-203ENST00000578798 695 ntTSL 311.76□□□□□ -0.538e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.588e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.668e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NAT9-207ENST00000579218 583 ntTSL 510.23□□□□□ -0.778e-9■■■■■ 31
SF3B4Q15427 NUP214-206ENST00000470765 620 ntTSL 57.97□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 31
SF3B4Q15427 TIMM44-208ENST00000598968 797 ntTSL 320.52■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 TIMM44-206ENST00000598481 587 ntTSL 215.62■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 31
SF3B4Q15427 TIMM44-202ENST00000595565 868 ntTSL 312.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 TIMM44-209ENST00000599650 921 ntTSL 212.27□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 31
SF3B4Q15427 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-211ENST00000591824 846 ntTSL 514.84□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-206ENST00000586823 575 ntTSL 414.34□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 HARS-210ENST00000507746 950 ntTSL 514.3□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 31
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