Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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