Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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