Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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