Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRCAPQ14761 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAPQ14761 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms