Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BECN1Q14457 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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