Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIDRQ14159 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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