Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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