Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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COL4A6Q14031 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL4A6Q14031 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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COL4A6Q14031 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL4A6Q14031 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL4A6Q14031 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL4A6Q14031 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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