Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCINQ13939 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCINQ13939 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCINQ13939 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCINQ13939 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCINQ13939 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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