Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPSQ13938 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms