Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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GTF2H3Q13889 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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GTF2H3Q13889 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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GTF2H3Q13889 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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GTF2H3Q13889 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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GTF2H3Q13889 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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GTF2H3Q13889 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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GTF2H3Q13889 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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