Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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ITGA9Q13797 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms