Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOFQ13790 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
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