Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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TUBA3CQ13748 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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