Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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