Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4AQ13619 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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