Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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NAE1Q13564 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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