Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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