Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RESTQ13127 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RESTQ13127 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RESTQ13127 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RESTQ13127 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RESTQ13127 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RESTQ13127 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RESTQ13127 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RESTQ13127 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RESTQ13127 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RESTQ13127 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RESTQ13127 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms