Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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