Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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