Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC20Q12834 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC20Q12834 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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