Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TROQ12816 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TROQ12816 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TROQ12816 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TROQ12816 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TROQ12816 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TROQ12816 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TROQ12816 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TROQ12816 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms