Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms