Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms