Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms