Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBQ06643 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LTBQ06643 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms