Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms