Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPB1Q06547 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms