Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms