Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR4Q05215 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR4Q05215 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms