Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms