Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms