Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms