Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2C1P98194 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms