Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms