Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms